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MMUPHin
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MMUPHin
微生物组研究异质性的统一管道元分析方法
Bioconductor版本:发行版(3.16)
MMUPHin是一个用于微生物组群元分析任务的R包。它具有以下功能接口:a)协变量控制的批和队列效应调整，b)元分析差异丰度测试，c)元分析无监督离散结构(聚类)发现，d)元分析无监督连续结构发现。
作者:马思远
维护者:思源MA
引文(从R内，输入引用(“MMUPHin”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“MMUPHin”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MMUPHin |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(3年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6) |
| 进口 | Maaslin2，metafor，fpc，igraph，ggplot2，dplyr，tidyr，stringr，cowplot， utils, stats, grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，magrittr，素食主义者，phyloseq，curatedMetagenomicData，genefilter |
| SystemRequirements | GLPK (>= 4.57) |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | MMUPHin_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MMUPHin_1.12.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | MMUPHin_1.12.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | MMUPHin_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMUPHin |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MMUPHin |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MMUPHin/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MMUPHin/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
