Bioconductor版本:版本(3.15)
通路分析基于假定值相关基因的基因表达分析的兴趣。效用函数可以从基因本体中提取途径生物过程(GOBP),分子功能(GOMF)和细胞组件(GOCC),京都基因的基因组百科全书(KEGG)和Reactome数据库。方法,并辅助函数来显示结果表,barplot途径的意义,基因本体图和路径意义是可用的。
作者:Nandini Raghavan (aut),托拜厄斯韦贝克(aut),损坏:De Bondt一(aut)哈维尔·卡布瑞拉(施),Dhammika Amaratunga[所有],齿Casneuf[所有],威廉Ligtenberg[所有],罗兰Cougnaud (cre) Katarzyna Gorczak(施)
维护人员:Tobias韦贝克<托拜厄斯。韦贝克在openanalytics.eu >
从内部引用(R,回车引用(“延时”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“延时”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“延时”)
R脚本 | UsingMLP | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.44.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(11.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | AnnotationDbi,gplots、图形数据,跑龙套 |
链接 | |
建议 | GO.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Mmu.eg.db,KEGGREST,注释,Rgraphviz,GOstats,图,limma,mouse4302.db,reactome.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | esetVis |
建议我 | a4 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | MLP_1.44.0.tar.gz |
Windows二进制 | MLP_1.44.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | MLP_1.44.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MLP |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/延时 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MLP/ |
包下载报告 | 下载数据 |