Bioconductor版本:版本(3.15)
DNA甲基化包含的信息监管状态的细胞。米拉公司聚集成DNA甲基化DNA甲基化数据概要文件对于一个给定的地区设置共享生物注释。使用此配置文件,米拉推断和成绩的集体管理活动对该地区集。米拉促进监管分析古典监管的情况下分析将会困难,而且还要允许将公共资源地区集用于小说了解DNA甲基化数据集的管理状态。
作者:内森·谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut) Christoph烈性黑啤酒(施),约翰·劳森(aut (cre)
维护人员:约翰·劳森< jtl2hk virginia.edu >
从内部引用(R,回车引用(“米拉”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“米拉”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“米拉”)
HTML | R脚本 | 米拉应用到一个生物问题 |
HTML | R脚本 | 开始使用Methylation-based推理的监管活动 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
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版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.5) |
进口 | BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,ggplot2,Biobase统计数据,bsseq、方法 |
链接 | |
建议 | knitr平行,testthat,BiocStyle,rmarkdown,AnnotationHub,萝拉 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://databio.org/mira |
BugReports | https://github.com/databio/MIRA |
取决于我 | |
进口我 | 可可 |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | MIRA_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | MIRA_1.18.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | MIRA_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/米拉 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MIRA/ |
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