- 家
- Biocumon 3.13
- 软件包
- 冰雹
冰雹
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI：10.18129 / b9.bioc.medips.
DNA IP-SEQ数据分析
Bioconductor版本：释放（3.13）
开发了用于分析衍生自甲基化DNA免疫沉淀（MedIP）实验的数据，然后进行测序（MedIP-SEQ）。然而，Medips提供了分析任何类型的定量测序数据（例如芯片-SEQ，MBD-SEQ，CMS-SEQ，CMS-SEQ，其他）的功能，包括计算样品和饱和和饱和分析组之间的差分覆盖。
作者：Lukas Chavez，Matthias Lienhard，Joern Dietrich，Isaac Lopez Moyado
维护者：Lukas Chavez
引文（从R内，输入引文（“Medips”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“Medips”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“Medips”）
| PDF. | r script. | 冰雹 |
| PDF. | 参考手册 |
细节
| Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.44.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 2.7（R-2.12）（10.5岁） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 依靠 | r（> = 3.0），bsgenome.那RSAMTOOLS. |
| 进口 | Genomicranges.那生物仪器，图形，GTOOLS.那绞喉，方法，统计数据，utils，edger.那dnacopy.那生物雕那rtracklayer.那预处理核 |
| 链接到 | |
| 建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那medipsdata.那生物焦 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | medips_1.44.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | medips_1.44.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | medips_1.44.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/medive. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocumon.org：包/发音 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/medive/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
