mbt

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBttest

多个βt

Bioconductor版本:版本(3.16)

mbt方法由βt Baggerly et al(2003)的方法。相比baySeq(硬城堡和凯利2010年),DESeq(2010年安德斯和Huber)和准确的测试(罗宾逊2007年史密斯,2008)和麦卡锡et al(2012)的漠视,mbt高工作效率,也就是说,它具有高功率,高罗斯福的保守估计和高稳定性。mbt是西装——能够转录组数据,标记数据,SAGE数据(统计数据)小样本或几个复制库。它可以用来识别基因,信使rna亚型或标签两种情况之间的差异表达。

作者:Yuan-De谭

维护人员:Yuan-De Tan < tanyuande gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(mbt)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (mbt)

PDF	R脚本	分析与“mbt”包RNA-Seq计数数据
PDF		MBttest-manual.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 3.3.0),统计数据,gplots,gtools、图形、基地,跑龙套,grDevices
进口
链接
建议	BiocStyle,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MBttest_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	MBttest_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MBttest_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MBttest_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBttest
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mbt
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MBttest/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MBttest/
包下载报告	下载数据