Bioconductor版本:发行版(3.16)
微生物组批量效应校正套件(MBECS)提供了一组功能来评估和减轻由于批量处理而产生的无水噪声。为此,它从不同的软件包中集成了大量的批处理纠正算法(BECA)。此外,它还提供了一个校正和报告管道,可以初步了解数据集在校正批处理效应之前和之后的特征。
维护者:Michael Olbrich
引文(从R内,输入引用(“MBECS”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MBECS”)
超文本标记语言 | R脚本 | MBECS介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | 方法,magrittr,phyloseq,limma,lme4,lmerTest,pheatmap,rmarkdown,集群,dplyr,ggplot2,gridExtra,ruv,股东价值分析,宠物猫,tidyr,素食主义者,统计,utils,矩阵 |
链接 | |
建议 | knitr,减价,BiocStyle,testthat(> = 3.0.0) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/rmolbrich/MBECS |
BugReports | https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MBECS_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | MBECS_1.2.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBECS |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBECS |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MBECS/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MBECS/ |
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