MBECS

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBECS

微生物组数据集中批效应的评价和修正

Bioconductor版本:发行版(3.16)

微生物组批量效应校正套件(MBECS)提供了一组功能来评估和减轻由于批量处理而产生的无水噪声。为此,它从不同的软件包中集成了大量的批处理纠正算法(BECA)。此外,它还提供了一个校正和报告管道,可以初步了解数据集在校正批处理效应之前和之后的特征。

作者:Michael Olbrich [aut, cre]

维护者:Michael Olbrich

引文(从R内,输入引用(“MBECS”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“MBECS”)

超文本标记语言 R脚本 MBECS介绍
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细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1)
进口 方法,magrittrphyloseqlimmalme4lmerTestpheatmaprmarkdown集群dplyrggplot2gridExtraruv股东价值分析宠物猫tidyr素食主义者,统计,utils,矩阵
链接
建议 knitr减价BiocStyletestthat(> = 3.0.0)
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URL https://github.com/rmolbrich/MBECS
BugReports https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new
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源包 MBECS_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 MBECS_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)
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源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBECS
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBECS
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MBECS/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MBECS/
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