mbased

doi:10.18129/b9.bioc

包含用于使用荟萃分析基于等位基因特异性表达检测的ASE分析功能的函数

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包实现了基于MB的算法,用于从RNA计数数据中检测等位基因特异性基因表达,其中将等位基因计数在单个基因座(SNV)集成为ASE基因特异性度量,并利用模拟来适当评估观察到的ASE的统计学意义。

作者:Oleg Mayba,休斯顿吉尔伯特

维护者:Oleg Mayba

引用(从r内,输入引用(“ mbased”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ mbased”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ mbased”)

PDF R脚本 mbased
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.30.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(8年)
执照 艺术2.0
要看 运行,,,,生物基因,,,,生物比较,,,,基因组机,,,,总结性特征
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建议 生物使用
系统要求
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构建报告

包装档案

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源包 mbased_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 MBASED_1.30.0.ZIP(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) mbased_1.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbased
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/mbased
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mbased/
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