Madseq
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doi：10.18129/b9.bioc.madseq
使用大量平行测序数据的镶嵌性非整倍性检测和定量
生物导体版本：版本（3.15）
MADSEQ软件包提供了一组层次的Bayeisan模型，用于检测镶嵌性非整倍性，非整倍性类型的推断以及样品中非整倍体细胞分数的定量。
作者：Yu Kong，Adam Auton，John Murray Greally
维护者：yu kong
引用（从r内，输入引用（“ madseq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ madseq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Madseq”）
| html | R脚本 | R包Madseq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.5.0），rjags（> = 4.6） |
| 进口 | VGAM，，，，结尾，，，，BSGENOME，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，S4VECTORS， 方法，预处理，，，，基因组签名，，，，rsamtools，，，，生物弦，，，，基因组机，，，，iranges，，，，变体，，，，总结性特征，，，，GenomeInfodB，，，，rtracklayer，图形，统计，grdevices，utils，Zlibbioc，，，，VCFR |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ykong2/madseq |
| BugReports | https://github.com/ykong2/madseq/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | madseq_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MADSEQ_1.22.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | madseq_1.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/madseq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/madseq |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/madseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
