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M3Drop
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DOI:10.18129 / B9.bioc.M3Drop
Michaelis-Menten造型在单细胞RNASeq辍学
Bioconductor版本:版本(3.13)
这个包适合Michaelis-Menten模型在单细胞RNASeq辍学的模式数据。这个模型作为零识别显著变量(即差异表达)基因用于下游分析,如聚类细胞。
作者:塔卢拉安德鲁斯< tallulandrews gmail.com >
维修工:塔卢拉安德鲁斯< tallulandrews gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“M3Drop”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“M3Drop”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“M3Drop”)
| R脚本 | 介绍M3Drop | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 | |
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.4),numDeriv |
| 进口 | RColorBrewer,gplots,bbmle,statmodgrDevices,图形,统计数据,matrixStats,矩阵,irlba,reldist,Hmisc、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | ROCR,knitr,M3DExampleData,嘘,SingleCellExperiment,单片眼镜,修拉,Biobase |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/tallulandrews/M3Drop |
| BugReports | https://github.com/tallulandrews/M3Drop/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | scMerge |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | M3Drop_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | M3Drop_1.18.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | M3Drop_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/M3Drop |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ M3Drop |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/M3Drop/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
