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LowMACA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.LowMACA
LowMACA -通过一致性比对的低频突变分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
LowMACA包是一套简单的工具，通过一致性对齐来调查和分析几种蛋白质或pfam结构域的突变谱。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析，只需提供一组您感兴趣的基因或pfam域。
作者:Giorgio Melloni, Stefano de Pretis
维护者:Giorgio Melloni < Melloni。giorgio在gmail.com>， Stefano de Pretis
引文(从R内，输入引用(“LowMACA”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“LowMACA”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | HTML文档的Bioconductor样式 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 | |
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(8年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 2.10) |
| 进口 | cBioPortalData平行,stringr，reshape2，data.table，RColorBrewer、方法、LowMACAAnnotation，BiocParallel，motifStack，Biostrings，httr、网格gridBase，plyr |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | Clustalo, gs, perl |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | LowMACA_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | LowMACA_1.28.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | LowMACA_1.28.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LowMACA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LowMACA |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/LowMACA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LowMACA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
