Bioconductor版本:版本(3.16)
LineagePulse是一个微分表达式和表达模型拟合包适合单细胞RNA-seq数据(scRNA-seq)。LineagePulse占批处理效果,退出和可变测序深度。可以使用LineagePulse执行纵向差异表达分析在拟时间之间的连续协调或离散的细胞组织(例如预定义的集群或实验条件)。适合可以直接从LineagePulse表达模型。
作者:大卫·费舍尔(aut (cre),费边赛思(施),近红外光谱Yosef(施)
维护人员:大卫·菲舍尔S <大卫。费舍尔在helmholtz-muenchen.de >
从内部引用(R,回车引用(“LineagePulse”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“LineagePulse”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“LineagePulse”)
HTML | R脚本 | LineagePulse |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | BiocParallel,circlize编译器,ComplexHeatmap,ggplot2,gplots、grDevices、网格knitr,矩阵、方法、RColorBrewer,SingleCellExperiment样条函数、统计数据SummarizedExperiment,跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/YosefLab/LineagePulse/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | LineagePulse_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | LineagePulse_1.18.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | LineagePulse_1.18.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | LineagePulse_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LineagePulse |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LineagePulse |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/LineagePulse/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LineagePulse/ |
包下载报告 | 下载数据 |