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萝拉
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DOI：10.18129 / b9.bioc.lola.
基因座重叠分析，以获得基因组范围的富集
Biocometiond版本：释放（3.12）
提供用于测试带有公共和自定义区域（基因组范围）数据库的基因组区域集的重叠的功能。这使得可以对基因组区域组进行自动富集分析，从而促进功能基因组学和表观瘤数据的解释。
作者：Nathan Sheffield
维护者：Nathan Sheffield
引文（从R内，输入引文（“萝拉”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“lola”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“萝拉”）
| HTML. | r script. | 1.洛拉开始 |
| HTML. | r script. | 2.使用萝拉核心 |
| HTML. | r script. | 3.选择一个宇宙 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.2（R-3.2）（5.5岁） |
| 执照 | GPL-3 |
| 依靠 | r（> = 2.10） |
| 进口 | 生物根系那S4Vectors.那绞喉那Genomicranges.那data.table.那重塑2.，utils，stats，方法 |
| 链接到 | |
| 建议 | 平行，testthat.那kn那生物焦那RAMAMAMDOW. |
| 系统要求 | |
| 加强 | simplecache.那QValue.那ggplot2. |
| URL. | http://code.databio.org/lola. |
| Bugreports. | http://github.com/nsheff /lola. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 可可那德布勒那米拉 |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | lola_1.20.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | lola_1.20.0.zip.（32-＆64位） |
| Macos 10.13（高塞拉） | lola_1.20.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/lola. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/萝拉 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/lola/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
