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蕾丝
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DOI：10.18129 / b9.bioc.lace.
癌症进化纵向分析（蕾丝）
Bioconductor版本：释放（3.13）
蕾丝是一种算法框架，其从不同时间点和不同的实验设置中收集的癌症样本处理单细胞体细胞突变谱，以产生致癌癌症演化的纵向模型。该方法通过最大化在多个时间点计算的称重似然函数来解决系统发育约束的布尔矩阵分解问题。
作者：Daniele Ramazzotti [Aut]
，Fabrizio Angaroni [Aut]，Davide Maspero [Cre，Aut]，Alex Graudenzi [Aut]，Luca de Sano [CTB]
维护者：Davide Maspero
引文（从R内，输入引文（“蕾丝”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“蕾丝”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“蕾丝”）
| PDF. | r script. | 蕾丝 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.11（R-4.0）（1年） |
| 执照 | 文件执照 |
| 依靠 | r（> = 4.0.0） |
| 进口 | data.tree，图形，grdevices，iGraph.， 平行，rcolorbrewer.那rfast.，统计，概括分析，实用程序 |
| 链接到 | |
| 建议 | 生物根系那生物焦那testthat.那kn |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/bimib-disco/lace. |
| Bugreports. | https://github.com/bimib-disco/lace. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | lace_1.4.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | lace_1.4.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | lace_1.4.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/lace. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包装/花边 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/lace/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
