kegggraph
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doi：10.18129/b9.bioc.kegggraph
kegggraph：在R和bioconductor中使用的kegg途径的图形方法
生物导体版本：版本（3.15）
Kegggraph是Kegg途径和图对象之间的接口，也是分析，剖析和可视化这些图形的工具集合。它将定期更新的KGML（KEGG XML）文件解析为维护所有基本途径属性的图形模型。该软件包提供功能，包括解析，图形操作，可视化和等。
作者：Jitao David Zhang，Paul Shannon的投入
维护者：Jitao David Zhang
引用（从r内，输入引用（“ kegggraph”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ kegggraph”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ kegggraph”）
| R脚本 | kegggraph：应用程序示例 | |
| R脚本 | kegggraph：kegg途径的图形方法 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.56.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.4（R-2.9）（13年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 方法，XML（> = 2.3-0），图形，utils，rcurl，，，，rgraphviz |
| 链接 | |
| 建议 | rbgl，，，，测试，，，，rcolorbrewer，，，，org.hs.eg.db，，，，hgu133plus2.db，，，，Spia |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.nextbiomotif.com |
| 取决于我 | 隆顿，，，，Spia |
| 进口我 | 快船，，，，degraph，，，，富集兄弟，，，，kegglincs，，，，代谢信号，，，，mwastools，，，，ncigraph，，，，PathView，，，，PFP |
| 建议我 | degraph，，，，基因组机 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | kegggraph_1.56.0.tar.gz |
| Windows二进制 | kegggraph_1.56.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | kegggraph_1.56.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kegggraph |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/kegggraph |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/kegggraph/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
