Bioconductor版本:发布(3.15)
一个提供京都基因与基因组百科全书(KEGG) REST服务器的客户机接口的包。基于J. Zhang, R. Gentleman和Marc Carlson的KEGGSOAP,以及Aurelien Mazurie的KEGG (python包)。
作者:Dan Tenenbaum [aut], Jeremy Volkening [ctb], Bioconductor Package维护者[aut, cre]
维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >
引用(来自R,输入引用(“KEGGREST”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.2")并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("KEGGREST")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“KEGGREST”)
超文本标记语言 | R脚本 | 访问KEGG REST API |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.36.3 |
在Bioconductor中 | BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | 方法,httr,png,Biostrings |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | Hiiragi2013,ROntoTools |
进口我 | 亚当,adSplit,AnnotationDbi,吸引,BiocSet,ChIPpeakAnno,cn,EnrichmentBrowser,famat,小伙子,计,KEGGlincs,MetaboSignal,MWASTools,NoRCE,PADOG,pairkat,pathview,RnaSeqSampleSize,SBGNview,击杀,transomics2cytoscape,YAPSA |
建议我 | 类别,categoryCompare,GenomicRanges,globaltest,iSEEu,中长期规划,莲花,RTopper |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | KEGGREST_1.36.3.tar.gz |
Windows二进制 | KEGGREST_1.36.3.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | KEGGREST_1.36.3.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/KEGGREST |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/KEGGREST |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGREST/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
bioc3.15的旧源包 | 源存档 |