Intramirexplorer
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doi：10.18129/b9.bioc.intramirexplorer
预测果蝇内miRNA的靶标
生物导体版本：版本（3.15）
MIR-MIR-explorer是一种综合miRNA目标预测生物信息学工具，确定了给定microRNA（MIR）的表达和生物物理相互作用的靶标。使用该工具，我们使用了来自Affymetrix 1和AffyMetrix2微阵列阵列平台的可用微阵列表达数据的D. melanogaster中92个基因内miR的靶标，提供了果蝇中基因内miR靶标的全局视角。使用David Gene本体论工具根据生物学功能对预测目标进行分组，并根据生物学相关的评分系统进行对，从而使用户能够识别给定MIR的功能相关目标。
作者：Surajit Bhattacharya和Daniel Cox
维护者：surajit bhattacharya
引用（从r内，输入引用（“ IntramireXplorer”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Intramirexplorer”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ IntramireXplorer”）
| html | R脚本 | Intramirexplorer |
| Intramirexplorer.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | Igraph（> = 1.0.1），fgnet（> = 3.0.7），尼特（> = 1.12.3），统计，UTILS，GRDEVICES，图形 |
| 链接 | |
| 建议 | Gprofiler，，，，topgo，，，，org.dm.eg.db，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/vilainlab/intramirexplorer |
| BugReports | https://github.com/vilainlab/intramirexplorer |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
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| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Intramirexplorer_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Intramirexplorer_1.18.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Intramirexplorer_1.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/intramirexplorer |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/intramirexplorer |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/intramirexplorer/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
