互动

DOI：10.18129 / b9.bioc.interationset.

用于存储基因组交互数据的基类

Biocometiond版本：释放（3.12）

提供来自Hi-C和Chia-PET实验的存储和操纵基因组交互数据的GinterAction，InteractioneTet和ContactMatrix对象和相关方法。

作者：Aaron LUN [AUT，CRE]，Malcolm Perry [Aut]，Elizabeth Ing-Simmons [Aut]

维护者：Aaron LUN

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！qualocmanage（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“interactionset”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“INTERATIONSETET”）

HTML.	r script.	基因组互动课程
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.18.1
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	GPL-3.
依靠	Genomicranges.那概括分析
进口	方法，矩阵那rcpp.那生物根系那S4Vectors.（> = 0.27.12），绞喉那Genomeinfodb.
链接到	rcpp.
建议	testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那生物焦
系统要求	C ++ 11.
加强
URL.
取决于我	Diffhic.那基因组互动那宏伟那塞塞伦
进口我	CageFightr.那hiccompare.那TrackViewer.
建议我	CageWorkflow.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	interactionst_1.18.1.tar.gz.
Windows二进制文件	interactionset_1.18.1.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	interactioneT_1.18.1.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/InterIonset
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/互补
包短网址	https://biocumon.org/packages/InterIonsetet/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包	源档案