intad
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doi：10.18129/b9.bioc.intad
在TAD中搜索表观遗传信号和基因表达之间的相关性
生物导体版本：版本（3.13）
该软件包的重点是检测表达基因和所选表观基因组信号之间的相关性（即，从CHIP-SEQ数据获得的增强剂）要么在拓扑相关的域（TADS）或染色质接触循环锚点之间。可以控制各种参数以研究外部因素的影响，并为每个分析步骤提供可视化图。
作者：Konstantin Okonechnikov，Serap Erkek，Lukas Chavez
维护者：konstantin okonechnikov
引用（从r内，输入引用（“ intad”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ intad”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ intad”）
| html | R脚本 | TAD中表观遗传信号和基因的相关性 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（3年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.5），方法，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，多亚sayExexperiment，，，，总结性特征，统计 |
| 进口 | 生物基因，，，，生物酶，，，，rtracklayer，并行，图形，mclust，，，，QVALUE，，，，GGPLOT2，utils，ggpubr |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | intad_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | intad_1.12.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | intad_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/intad |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/intad |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/intad/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
