ImmuneSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImmuneSpaceR

免疫空间数据库的薄包装器

Bioconductor版本:发行版(3.13)

提供一个方便的API，用于访问免疫空间(www.immunespace.org)中的数据集，免疫空间是人类免疫项目联盟(HIPC)的数据存储库和分析平台。

作者:Greg Finak [aut]， Renan Sauteraud [aut]， Mike Jiang [aut]， Gil Guday [aut]， Leo Dashevskiy [aut]， Evan Henrich [aut]， Ju Yeong Kim [aut]， Lauren Wolfe [aut]， Helen Miller [aut]， Raphael Gottardo [aut]， ImmuneSpace Package Maintainer [cre, cph]

维护者:ImmuneSpace Package Maintainer < ImmuneSpace at gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("免疫空间")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ImmuneSpaceR”)

超文本标记语言	R脚本	免疫空间包简介
超文本标记语言	R脚本	使用getDataset下载数据集
超文本标记语言	R脚本	用免疫空间处理表达式矩阵
超文本标记语言	R脚本	interactive_netrc()函数演练
超文本标记语言	R脚本	SDY144: HAI/病毒中和滴度与细胞计数的相关性
超文本标记语言	R脚本	SDY180:用多参数流式细胞仪测定浆母细胞丰度
超文本标记语言	R脚本	SDY269: HAI与流式细胞仪和ELISPOT结果的相关性
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细节

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版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	跑龙套,R6，data.table，旋度，httr，Rlabkey(> = 2.3.1),Biobase，pheatmap，ggplot2(> = 3.2.0),尺度统计数据,gplots，情节，的热图(> = 0.7.0),jsonlite，rmarkdown，preprocessCore，flowCore，flowWorkspace，消化
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR
BugReports	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ImmuneSpaceR_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	ImmuneSpaceR_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ImmuneSpaceR_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ImmuneSpaceR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ImmuneSpaceR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ImmuneSpaceR/
软件包下载报告	下载数据