ImmuneSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImmuneSpaceR

免疫空间数据库的薄包装器

Bioconductor版本:发行版(3.13)

提供一个方便的API,用于访问免疫空间(www.immunespace.org)中的数据集,免疫空间是人类免疫项目联盟(HIPC)的数据存储库和分析平台。

作者:Greg Finak [aut], Renan Sauteraud [aut], Mike Jiang [aut], Gil Guday [aut], Leo Dashevskiy [aut], Evan Henrich [aut], Ju Yeong Kim [aut], Lauren Wolfe [aut], Helen Miller [aut], Raphael Gottardo [aut], ImmuneSpace Package Maintainer [cre, cph]

维护者:ImmuneSpace Package Maintainer < ImmuneSpace at gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“ImmuneSpaceR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("免疫空间")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ImmuneSpaceR”)

超文本标记语言 R脚本 免疫空间包简介
超文本标记语言 R脚本 使用getDataset下载数据集
超文本标记语言 R脚本 用免疫空间处理表达式矩阵
超文本标记语言 R脚本 interactive_netrc()函数演练
超文本标记语言 R脚本 SDY144: HAI/病毒中和滴度与细胞计数的相关性
超文本标记语言 R脚本 SDY180:用多参数流式细胞仪测定浆母细胞丰度
超文本标记语言 R脚本 SDY269: HAI与流式细胞仪和ELISPOT结果的相关性
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 跑龙套,R6data.table旋度httrRlabkey(> = 2.3.1),Biobasepheatmapggplot2(> = 3.2.0),尺度统计数据,gplots情节的热图(> = 0.7.0),jsonlitermarkdownpreprocessCoreflowCoreflowWorkspace消化
链接
建议 knitrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR
BugReports https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ImmuneSpaceR_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 ImmuneSpaceR_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ImmuneSpaceR_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ImmuneSpaceR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ImmuneSpaceR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ImmuneSpaceR/
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