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IgGeneUsage
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DOI:10.18129 / B9.bioc.IgGeneUsage
不同基因在免疫系统中的应用
Bioconductor版本:Release (3.15)
检测属于不同生物条件的适应性免疫组间免疫球蛋白(Ig)基因使用的偏差是免疫组谱分析的重要任务。IgGeneUsage使用概率模型检测异常的Ig基因使用，该模型通过贝叶斯推理进行计算分析。
作者:Simo Kitanovski [aut, cre]
维护者:Simo Kitanovski < Simo。基塔诺夫斯基在uni-due.de>
引文(从R内，输入引用(“IgGeneUsage”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“IgGeneUsage”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用户手册:IgGeneUsage |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(3年) |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | ， R (>= 3.6.0)，Rcpp(> = 0.12.0),SummarizedExperiment，StanHeaders(> 2.18.1) |
| 进口 | rstan(> = 2.19.2),reshape2(> = 3) |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat(> =魅惑,ggplot2，ggforce，gridExtra，ggrepel |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/snaketron/IgGeneUsage/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | IgGeneUsage_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13 (High Sierra) | IgGeneUsage_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IgGeneUsage |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IgGeneUsage |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/IgGeneUsage/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
