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HiTC
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DOI:10.18129 / B9.bioc.HiTC
高通量染色体构象捕获分析
Bioconductor版本:发行版(3.13)
HiTC包的开发是为了探索高通量的“C”数据，如5C或Hi-C。还提供了专门的R类以及用于质量控制、规范化、可视化和进一步分析的标准方法。
作者:Nicolas Servant
维护者:Nicolas Servant < Nicolas。curie.fr>的仆人
引文(从R内，输入引用(类似“HiTC”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("HiTC")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(类似“HiTC”)
| R脚本 | 利用HiTC进行Hi-C数据分析 | |
| R脚本 | HiTC包介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.10 (R-2.15)(9年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(>= 2.15.0)，方法，IRanges，GenomicRanges |
| 进口 | Biostrings，图形，grDevices，rtracklayer，RColorBrewer，矩阵平行,GenomeInfoDb |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，HiCDataHumanIMR90 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | HiCDataHumanIMR90，HiCDCPlus |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | HiTC_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | HiTC_1.36.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | HiTC_1.36.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiTC |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HiTC |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HiTC/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
