希尔达

doi:10.18129/b9.bioc.hilda

通过使用层次潜在差异分配进行统计推断,以比较突变特征的突变暴露

生物导体版本:版本(3.15)

在贝叶斯框架下构建的包装,用于应用层次的潜在dirichlet分配。它统计地测试了两组之间突变特征的突变暴露(Shiraishi-Model特征)是否有所不同。该软件包还提供推理和可视化。

作者:Zhi Yang [AUT,CRE],Yuichi Shiraishi [CTB]

维护者:zhi yang

引用(从r内,输入引用(“希尔达”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ hilda”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Hilda”)

html R脚本 希尔达简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 安装

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.1),GGPLOT2
进口 R2JAGS,,,,艾宾,,,,牛仔图, 网格,福卡,,,,Stringr,,,,基因组机,,,,S4VECTORS,,,,xvector,,,,生物弦,,,,GenomicFeatures,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,生物基因,,,,花花公子,grdevices,统计,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,utils,方法,RCPP
链接 RCPP
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用
系统要求 JAGS 4.0.0
增强
URL https://github.com/uscbiostats/hildahttps://doi.org/10.1101/577452
BugReports https://github.com/uscbiostats/hilda/issues
取决于我
进口我 Selectksigs
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 hilda_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 hilda_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) hilda_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hilda
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hilda
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/hilda/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网