生物导体版本:版本(3.15)
在贝叶斯框架下构建的包装,用于应用层次的潜在dirichlet分配。它统计地测试了两组之间突变特征的突变暴露(Shiraishi-Model特征)是否有所不同。该软件包还提供推理和可视化。
作者:Zhi Yang [AUT,CRE],Yuichi Shiraishi [CTB]
维护者:zhi yang
引用(从r内,输入引用(“希尔达”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ hilda”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Hilda”)
html | R脚本 | 希尔达简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 安装 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.1),GGPLOT2 |
进口 | R2JAGS,,,,艾宾,,,,牛仔图, 网格,福卡,,,,Stringr,,,,基因组机,,,,S4VECTORS,,,,xvector,,,,生物弦,,,,GenomicFeatures,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,生物基因,,,,花花公子,grdevices,统计,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,utils,方法,RCPP |
链接 | RCPP |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用 |
系统要求 | JAGS 4.0.0 |
增强 | |
URL | https://github.com/uscbiostats/hildahttps://doi.org/10.1101/577452 |
BugReports | https://github.com/uscbiostats/hilda/issues |
取决于我 | |
进口我 | Selectksigs |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | hilda_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | hilda_1.10.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | hilda_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hilda |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/hilda |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/hilda/ |
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