- 首页
- Bioconductor 3.13
- 软件包
- Harshlight
Harshlight
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.Harshlight
微阵列芯片的“校正补充”程序
生物导体版本:发布(3.13)
该封装用于检测微阵列芯片上的扩展、扩散和致密缺陷。Harshlight自动标记一组芯片(affybatch对象)中的区域，并返回一个校正过的affybatch对象，在该对象中，有缺陷的区域被NAs或该集合中其他芯片中相同探针值的中间值替换。新版本将替换值作为整个矩阵来处理，以解决内存问题。
作者:Mayte Suarez-Farinas, Maurizio Pellegrino, Knut M. Wittkowski, Marcelo O. Magnasco
维护人:Maurizio Pellegrino < pelellegri at berkeley.edu>
引文(从R中输入引用(“Harshlight”)）：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Harshlight")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“Harshlight”)
| R脚本 | Harshlight | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.64.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.9 (R-2.4)(14.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.10) |
| 进口 | affy，altcdfenvs，Biobase统计,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | Harshlight_1.64.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Harshlight_1.64.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | Harshlight_1.64.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Harshlight |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Harshlight |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Harshlight/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
