HTqPCR

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTqPCR

高通量qPCR数据的自动化分析

Bioconductor版本:版本(3.16)

从高通量分析Ct值定量实时PCR (qPCR)化验跨多个条件或复制。输入数据可以从spatially-defined格式(ABI TaqMan低密度阵列或OpenArray;LightCycler罗氏应用科学;排名板从Bio-Rad实验室;传统的96或384孔板;或微流控设备,如动态数组Fluidigm公司。HTqPCR处理数据加载、质量评估、标准化、可视化和参数或非参数测试的统计学意义的Ct值之间的特性(如基因、小分子核糖核酸)。

作者:海蒂Dvinge,保罗·伯顿

维护人员:海蒂Dvinge < hdvinge fredhutch.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HTqPCR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HTqPCR”)

PDF	R脚本	qPCR分析R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.52.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(13岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase,RColorBrewer,limma
进口	affy,Biobase,gplots、图形、grDeviceslimma、方法、RColorBrewer、统计、stats4跑龙套
链接
建议	statmod
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
取决于我
进口我	nondetects,unifiedWMWqPCR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HTqPCR_1.52.0.tar.gz
Windows二进制	HTqPCR_1.52.0.zip
macOS二进制(x86_64)	HTqPCR_1.52.0.tgz
macOS二进制(arm64)	HTqPCR_1.52.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTqPCR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HTqPCR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/HTqPCR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTqPCR/
包下载报告	下载数据