Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包是围绕HPAStainR函数构建的。HPAStainR函数的目的是查询Human Protein Atlas中的可视化染色数据,返回染色排序的细胞类型表。该函数还有多个参数可个性化输出,包括癌症数据、csv可读名称、修改结果的置信级别等。其他函数专门用于轻松获取运行HPAStainR所需的数据。
作者:Tim O. Nieuwenhuis [aut, cre]
维护者:Tim O. Nieuwenhuis
引文(从R内,输入引用(“HPAStainR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HPAStainR”)
超文本标记语言 | R脚本 | HPAStainR |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1.0),dplyr,tidyr |
进口 | 跑龙套,统计数据,尺度,stringr,宠物猫,闪亮的,data.table |
链接 | |
建议 | knitr,BiocManager,qpdf,hpar,testthat,rmarkdown |
SystemRequirements | 4GB内存 |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/tnieuwe/HPAstainR |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HPAStainR_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | HPAStainR_1.8.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | HPAStainR_1.8.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | HPAStainR_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAStainR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HPAStainR |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/HPAStainR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HPAStainR/ |
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