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GreyListChIP
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GreyListChIP
灰色列表——基于芯片输入的掩码人工制品区域
Bioconductor版本:发行版(3.13)
识别ChIP实验中输入高信号的区域，在峰值调用期间导致伪峰。在峰值调用之前删除对准这些区域的读取，以便更清晰地进行ChIP分析。
作者:Gord Brown
维护者:戈登布朗<戈登。布朗在cruk.cam.ac.uk>
引文(从R内，输入引用(“GreyListChIP”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“GreyListChIP”)
| R脚本 | 从输入库生成灰列表 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
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| 版本 | 1.24.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(>= 4.0)，方法，GenomicRanges |
| 进口 | GenomicAlignments，BSgenome，Rsamtools，rtracklayer，质量平行,GenomeInfoDb，SummarizedExperiment，统计，效用 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，BiocGenerics，RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | DiffBind，epigraHMM |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | GreyListChIP_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GreyListChIP_1.24.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | GreyListChIP_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GreyListChIP |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GreyListChIP |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GreyListChIP/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
