GmicR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GmicR

结合WGCNA和xCell读数与贝叶斯网络学习,生成基因模块免疫细胞网络(GMIC)

Bioconductor版本:发行版(3.13)

该软件包使用贝叶斯网络学习来检测由WGCNA检测到的基因模块和由xCell定义的免疫细胞签名之间的关系。它是一个假设生成工具。

作者:Richard Virgen-Slane

维护者:Richard Virgen-Slane

引文(从R内,输入引用(“GmicR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GmicR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GmicR”)

超文本标记语言 R脚本 GmicR_vignette
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

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版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证 GPL-2 +文件许可证
取决于
进口 AnnotationDbibnlearn类别DTdoParallelforeachgRbaseGSEABase粮食GOstatsorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.db闪亮的WGCNAdata.table, grDevices,图形,reshape2,统计,效用
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GmicR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 GmicR_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GmicR_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GmicR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GmicR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GmicR/
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