Globalancova
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通过模型比较对变量组的全局测试
生物导体版本：版本（3.15）
感兴趣的变量（例如两组）与一组变量（例如基因集）的全局模式之间的关联是通过全局F检验测试的。我们给出以下论点以支持Globalancova方法：经过适当的归一化，基因表达数据似乎相当对称，离群值并不是真正的问题，因此最小二乘应该相当强大。具有相互作用的ANCOVA产生饱和的数据建模，例如每个组和基因不同。协变量调整可以帮助纠正可能的选择偏差。差异同质性和不相关的残差无法预期。普通最小二乘的应用可无偏见，但不再是最佳估计（高斯 - 马科夫 - 艾特肯）。因此，由于相关性，使用经典的F检验是不合适的。然而，测试统计量反映了与零假设的偏差。结合置换方法，可以估算经验意义水平。 Alternatively, an approximation yields asymptotic p-values. The framework is generalized to groups of categorical variables or even mixed data by a likelihood ratio approach. Closed and hierarchical testing procedures are supported. This work was supported by the NGFN grant 01 GR 0459, BMBF, Germany and BMBF grant 01ZX1309B, Germany.
作者：U.Mansmann，R。Meister，M。Hummel，R。Scheufele，S。Knueppel的贡献
维护者：manuela hummel
引用（从r内，输入引用（“ Globalancova”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ GlobalAncova”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Globalancova”）
| R脚本 | Globalancova.pdf | |
| R脚本 | globalancovadecomp.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 4.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 1.7（R-2.2）（17年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | 方法，公司，，，，全球测试 |
| 进口 | 注释，，，，AnnotationDbi，，，，生物酶，，，，Dendextend，，，，gseabase，，，，VGAM |
| 链接 | |
| 建议 | go.db，，，，golubeset，，，，Hu6800.db，，，，VSN，，，，rgraphviz |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
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| 进口我 | 米尔特 |
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| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | globalancova_4.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | globalancova_4.14.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | globalancova_4.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/globalancova |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/globalancova |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/globalancova/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
