Generegionscan
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doi：10.18129/b9.bioc.generegionscan
Generegionscan
生物导体版本：版本（3.15）
专注于分析基因组离散区域的软件包。该软件包对于使用Affymetrix数据研究一个或几个基因很有用，因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级别数据，并将这些数据包装到ProbelevelSet中。probelevelset直接扩展了extressionset，但包括有关每个探针序列及其衍生的探针集的其他信息。该软件包包括许多用于绘制这些探针级别数据作为沿mRNA链序列的位置的函数的功能。这可用于分析可变剪接，并且特别适合与外显子数据数据一起使用。
作者：Lasse Folkersen，迭戈·迪兹
维护者：lasse folkersen
引用（从r内，输入引用（“ generegionscan”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ GenereGionScan”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ GenereGionscan”）
| R脚本 | Generegionscan | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.52.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.4（R-2.9）（13。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | 方法，生物酶（> = 2.5.5），生物弦 |
| 进口 | S4VECTORS（> = 0.9.25），生物酶（> = 2.5.5），affxparser，，，，rcolorbrewer，，，，生物弦 |
| 链接 | |
| 建议 | BSGENOME，，，，副词，，，，AnnotationDbi |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | generegionscan_1.52.0.tar.gz |
| Windows二进制 | generegionscan_1.52.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | generegionscan_1.52.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/generegionscan |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/generegionscan |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/generegionscan/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
