GenVisR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenVisR

基因组可视化在R

Bioconductor版本:发行版(3.15)

主要在队列级别为基因组数据生成高度可定制的出版质量图形。

作者:Zachary Skidmore [aut, cre]， Alex Wagner [aut]， Robert Lesurf [aut]， Katie Campbell [aut]， Jason Kunisaki [aut]， Obi Griffith [aut]， Malachi Griffith [aut]

维护者:Zachary Skidmore

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GenVisR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GenVisR”)

超文本标记语言	R脚本	GenVisR:介绍
超文本标记语言	R脚本	可视化小变异
超文本标记语言	R脚本	瀑布:功能介绍
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文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(6年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R(>= 3.3.0)，方法
进口	AnnotationDbi，biomaRt(> = 2.45.8),BiocGenerics，Biostrings，DBIFField,GenomicFeatures，GenomicRanges(> = 1.25.4),ggplot2(> =魅惑,gridExtra(> = 2.0.0),gtable，gtools，IRanges(> = 2.7.5),plyr(> = 1.8.3),reshape2，Rsamtools，尺度，冬青，data.table，BSgenome，GenomeInfoDb，VariantAnnotation
链接
建议	BiocStyle，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，knitr，RMySQL，roxygen2，testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，rmarkdown，vdiffr，formatR，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GenVisR_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	GenVisR_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GenVisR_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenVisR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenVisR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenVisR/
包下载报告	下载数据