Gwastools

doi：10.18129/b9.bioc.gwastools

基因组广泛关联研究工具

生物导体版本：版本（3.13）

用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类，以及用于GWAS数据清洁和分析的功能。

Author: Stephanie M. Gogarten, Cathy Laurie, Tushar Bhangale, Matthew P. Conomos, Cecelia Laurie, Michael Lawrence, Caitlin McHugh, Ian Painter, Xiuwen Zheng, Jess Shen, Rohit Swarnkar, Adrienne Stilp, Sarah Nelson, David Levine

维护者：Stephanie M. Gogarten

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gwastools”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Gwastools”）

PDF	R脚本	Gwastools中的数据格式
PDF	R脚本	GWAS数据清洁
PDF	R脚本	准备Affymetrix数据
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.38.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（9。5年）
执照	艺术2.0
要看	生物酶
进口	图形，统计，utils，方法，GDSFMT，，，，DBI，，，，rsqlite，，，，gwasexacthw，，，，DNACOPIGY，，，，生存，，，，三明治，，，，lmtest，，，，logistf，，，，颤抖，，，，Data.Table
链接
建议	NCDF4，，，，Gwasdata，，，，生物基因，，，，运行，，，，生物弦，，，，基因组机，，，，iranges，，，，Snprelate，，，，snpstats，，，，S4VECTORS，，，，变体， 平行
系统要求
增强
URL	https://github.com/smgogarten/gwastools
取决于我	Gwasdata，，，，MBPCR
进口我	创世纪，，，，Gwasurvivr
建议我	podkat
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	gwastools_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	gwastools_1.38.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	gwastools_1.38.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwastools
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/gwastools
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/gwastools/
软件包下载报告	下载统计