GSgalgoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSgalgoR

癌症预后基因表达特征识别和研究的进化框架

Bioconductor版本:发行版(3.16)

基于非支配排序遗传算法的疾病亚型发现多目标优化算法。“Galgo”框架结合了对异构“组学”数据进行分组的聚类算法的优势和用于特征选择的遗传算法的搜索特性。该算法在保持较高的聚类一致性的同时,考虑到各子类型之间的生存差异最大的特征,寻找最优聚类数量的确定。

作者:Martin Guerrero [aut], Carlos Catania [cre]

维护者:Carlos Catania

引文(从R内,输入引用(“GSgalgoR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GSgalgoR”)

超文本标记语言 R脚本 GSgalgoR.html
超文本标记语言 R脚本 GSgalgoR_callbacks.html
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

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版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于
进口 集群doParallelforeachmatchingRnsga2R生存代理、统计数据、方法
链接
建议 knitrrmarkdownggplot2BiocStylegenefusurvcompBiobasesurvminerbreastCancerTRANSBIGbreastCancerUPPiC10TrainingDatapamrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR
BugReports https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR/issues
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包档案

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源包 GSgalgoR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 GSgalgoR_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) GSgalgoR_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) GSgalgoR_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSgalgoR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSgalgoR
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GSgalgoR/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSgalgoR/
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