Bioconductor版本:发行版(3.16)
基于非支配排序遗传算法的疾病亚型发现多目标优化算法。“Galgo”框架结合了对异构“组学”数据进行分组的聚类算法的优势和用于特征选择的遗传算法的搜索特性。该算法在保持较高的聚类一致性的同时,考虑到各子类型之间的生存差异最大的特征,寻找最优聚类数量的确定。
作者:Martin Guerrero [aut], Carlos Catania [cre]
维护者:Carlos Catania
引文(从R内,输入引用(“GSgalgoR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GSgalgoR”)
超文本标记语言 | R脚本 | GSgalgoR.html |
超文本标记语言 | R脚本 | GSgalgoR_callbacks.html |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | 集群,doParallel,foreach,matchingR,nsga2R,生存,代理、统计数据、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,ggplot2,BiocStyle,genefu,survcomp,Biobase,survminer,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,iC10TrainingData,pamr,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR |
BugReports | https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GSgalgoR_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | GSgalgoR_1.8.0.zip(64位) |
macOS二进制文件(x86_64) | GSgalgoR_1.8.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | GSgalgoR_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSgalgoR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSgalgoR |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GSgalgoR/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GSgalgoR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |