GSReg

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSReg

基因集调控(GS-Reg)

Bioconductor版本:发行版(3.13)

一种基于表达可变性的基因集分析包以及一种检测替代剪接事件的方法。它实现了差分秩守恒(DIRAC)和基因集表达变异分析(EVA)方法。为检测差异剪接基因,提供了一种剪接eva (splicing - eva, SEVA)的实现。

作者:Bahman Afsari < Bahman at jhu.edu>, Elana J. Fertig

维护者:Bahman Afsari < Bahman at jhu.edu>, Elana J. Fertig

引文(从R内,输入引用(“GSReg”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GSReg")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GSReg”)

PDF R脚本 使用GSReg包
PDF 参考手册

细节

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版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.13.1),Homo.sapiensorg.Hs.eg.dbGenomicFeaturesAnnotationDbi
进口
链接
建议 GenomicRangesGSBenchMark
SystemRequirements
增强了
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全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GSReg_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 GSReg_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GSReg_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSReg
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GSReg
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSReg/
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