GOstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOstats

操作GO和微阵列的工具

Bioconductor版本:发行版(3.13)

一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本的图形操作工具，假设检验和其他简单的计算。

作者:Robert Gentleman [aut]， Seth Falcon [ctb]， Robert Castelo [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GOstats")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GOstats”)

PDF	R脚本	对不常见的模型生物的超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats进行超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats可视化数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	2.58.0
在Bioconductor公司	BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 16年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图
进口	Methods, stats, stats4，AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL，注释(> = 1.13.2),AnnotationForge，Rgraphviz
链接
建议	hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有，乘，genefilter，RColorBrewer，xtable，SparseM，GSEABase，geneplotter，org.Hs.eg.db，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	MineICA，PloGO2，RDAVIDWebService
进口我	affycoretools，吸引，categoryCompare，GmicR，理想的，MIGSA，miRLAB，pcaExplorer，ReportingTools，scTensor，systemPipeR
建议我	a4，BiocCaseStudies，类别，eisa，fastLiquidAssociation，fgga，GSEAlm，interactiveDisplay，MineICA，中长期规划，qpgraph，RnBeads，安全
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GOstats_2.58.0.tar.gz
Windows二进制	GOstats_2.58.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GOstats_2.58.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/GOstats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOstats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GOstats/
软件包下载报告	下载数据