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GNET2
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GNET2
通过功能模块推理从表达数据构建基因调控网络
Bioconductor版本:发行版(3.16)
通过E-M过程将基因聚成功能基团。迭代执行TF赋值和Gene赋值，直到基因赋值不变或达到最大迭代次数。
作者:陈晨，侯杰，程建林
维护者:陈晨
引文(从R内，输入引用(“GNET2”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“GNET2”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用GNET2构建功能基因模块 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年) |
| 许可证 | Apache License 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.6) |
| 进口 | ggplot2，xgboost，Rcpp，reshape2、网格图，方法，统计，matrixStats、图形、SummarizedExperiment，dplyr，igraph， grDevices, utils |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/chrischen1/GNET2 |
| BugReports | https://github.com/chrischen1/GNET2/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | GNET2_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GNET2_1.14.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | GNET2_1.14.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | GNET2_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GNET2 |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GNET2 |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GNET2/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GNET2/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
