GISPA

DOI:10.18129 / B9.bioc.GISPA

GISPA:基因集成集剖面分析方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

GISPA是一种为研究人员设计的方法,他们有兴趣定义具有相似的,先验指定的分子剖面的基因集。GISPA方法此前已发表在《核酸研究》(Kowalski et al., 2016;PMID: 26826710)。

作者:巴克蒂·德维维迪和珍妮·科瓦尔斯基

维护:Bhakti Dwivedi < Bhakti。Dwivedi在emoryedu >

引文(从R内,输入引用(“GISPA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GISPA”)

超文本标记语言 R脚本 GISPA:基因集成集剖面分析方法
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细节

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版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.5)
进口 Biobasechangepointdata.tablegenefilter、图形、GSEABaseHH晶格latticeExtraplyrscatterplot3d,统计数据
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GISPA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 GISPA_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) GISPA_1.22.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) GISPA_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GISPA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GISPA
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GISPA/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GISPA/
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