Bioconductor版本:发行版(3.16)
GISPA是一种为研究人员设计的方法,他们有兴趣定义具有相似的,先验指定的分子剖面的基因集。GISPA方法此前已发表在《核酸研究》(Kowalski et al., 2016;PMID: 26826710)。
作者:巴克蒂·德维维迪和珍妮·科瓦尔斯基
维护:Bhakti Dwivedi < Bhakti。Dwivedi在emoryedu >
引文(从R内,输入引用(“GISPA”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GISPA”)
超文本标记语言 | R脚本 | GISPA:基因集成集剖面分析方法 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | Biobase,changepoint,data.table,genefilter、图形、GSEABase,HH,晶格,latticeExtra,plyr,scatterplot3d,统计数据 |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GISPA_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | GISPA_1.22.0.zip(64位) |
macOS二进制文件(x86_64) | GISPA_1.22.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | GISPA_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GISPA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GISPA |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GISPA/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GISPA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |