火焰
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DOI:10.18129 / B9.bioc.FLAMES
火焰:长读取RNA-seq数据中突变和剪接的全长分析
Bioconductor版本:Release (3.15)
来自批量和单细胞长读取RNA-seq数据的半监督式异构体检测和注释。flame提供了分析异构体的自动化管道，以及手动执行的中间功能。
作者:田鲁一[aut]， Voogd Oliver [aut, cre]， Schuster Jakob [aut]，王长庆[aut]，苏世安[aut]， Ritchie Matthew [ctb]
维护者:Voogd Oliver < Voogd。O在wehi.edu.au>
引文(从R内，输入引用(“火焰”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“火焰”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 火焰 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.2 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | 蛇怪，网状，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，Rsamtools跑龙套,zlibbioc，嘘，dplyr，tidyr，magrittr，S4Vectors，天窗统计数据,rtracklayer，igraph，ggbio，GenomicRanges，矩阵，BiocGenerics，ggplot2，食物，ComplexHeatmap，RColorBrewer，circlize、网格gridExtra，cowplot，stringr，bambu，GenomeInfoDb，withr，Biostrings，GenomicFeatures |
| 链接 | Rcpp，Rhtslib，zlibbioc |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，减价，BiocFileCache |
| SystemRequirements | GNU制作，c++ 11 |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/OliverVoogd/FLAMES |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | FLAMES_1.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | FLAMES_1.2.1.zip(64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | FLAMES_1.2.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FLAMES |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FLAMES |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FLAMES/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.15的旧源包 | 源存档 |
