FGNet

DOI:10.18129 / B9.bioc.FGNet

功能基因网络来源于生物富集分析

Bioconductor版本:版本(3.15)

构建和可视化功能基因和浓缩的聚类分析在多个注释术语网络空间。包包括一个图形用户界面(GUI)和功能进行功能富集分析通过大卫,GeneTerm链接器,计(GSEA)和topGO。

作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo,康拉德Droste和哈维尔·De Las里瓦斯。

维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FGNet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“FGNet”)

HTML	R脚本	FGNet
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	3.30.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	igraph(> = 0.6),hwriter,R.utils,XML,plotrix,reshape2,RColorBrewer,png、方法、数据、图形、grDevices跑龙套
链接
建议	RCurl,计,topGO,GO.db,reactome.db,RUnit,BiocGenerics,org.Sc.sgd.db,knitr,rmarkdown,AnnotationDbi,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cicancer.org
取决于我
进口我	IntramiRExploreR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	FGNet_3.30.0.tar.gz
Windows二进制	FGNet_3.30.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	FGNet_3.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FGNet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FGNet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FGNet/
包下载报告	下载数据