小伙子

doi:10.18129/b9.bioc.fella

代谢组学数据的解释和富集

生物导体版本:版本(3.15)

使用KEGG条目丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,Fella建议使用知识模型网络中使用标签传播的影响反应,酶,模块和途径。可以看到和导出所得的子网。

作者:Sergio Picart-Armada [AUT,CRE],Francesc Fernandez-Albert [aut],Alexandre Perera-llluna [aut]

维护者:sergio picart-armada

引用(从r内,输入引用(“ Fella”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ fella”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Fella”)

PDF R脚本 示例:脂肪肝脏研究
PDF R脚本 示例:镀金头式oxybenzone博览会
PDF R脚本 小伙子
html R脚本 快速开始
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.5.0)
进口 方法,Igraph,,,,矩阵,,,,keggrest,,,,plyr,统计,图形,utils
链接
建议 闪亮的,,,,DT,,,,马格里特,,,,Visnetwork,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Biomart,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,AnnotationDbi,,,,Gosemsim
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Fella_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 Fella_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Fella_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fella
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/伙伴
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/fella/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网