盛宴
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.feast
用于单细胞聚类的功能效果（盛宴）
生物导体版本：版本（3.15）
细胞聚类是单细胞RNA测序（SCRNA-SEQ）数据分析中最重要，最常见的任务之一。细胞聚类中的一个重要步骤是选择基因的子集（称为“特征”），然后将其表达模式用于下游聚类。一组良好的功能应包括区分不同细胞类型的功能，并且这种集合的质量可能会对聚类准确性产生重大影响。盛宴是一个R库，用于在执行SCRNA-Seq聚类的核心之前选择大多数代表性功能。它可以用作插入的聚类算法的插件，例如SC3，TSCAN，SHART，SIMLR和SEURAT。盛宴算法的核心包括三个步骤：1。共识聚类；2.基因水平的意义推断；3.验证优化的功能集。
作者：Kenong Su [Aut，Cre]，Hao Wu [aut]
维护者：kenong su
引用（从r内，输入引用（“盛宴”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ feast”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“盛宴”）
| html | R脚本 | 盛宴用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（1年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 4.1），mclust，，，，生物比较，，，，总结性特征 |
| 进口 | Singlecellexperiment，方法，统计，utils，irlba，，，，TSCAN，，，，SC3，，，，矩阵 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkDown，，，，Seurat，，，，ggpubr，，，，尼特，，，，测试（> = 3.0.0），生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/suke18/feast/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | feast_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | feast_1.4.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | feast_1.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/feast |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/盛宴 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/feast/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
