- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- ExpressionAtlas
ExpressionAtlas
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.ExpressionAtlas
阿特拉斯从EMBL-EBI下载数据集表达式
Bioconductor版本:版本(3.16)
这个包是为寻找数据集在EMBL-EBI表达图谱,并下载到R进行进一步分析。每个表达式图谱数据集表示为SimpleList对象每个平台的一个元素。测序数据中包含一个SummarizedExperiment对象,而微阵列数据都包含在一个ExpressionSet或MAList对象。
作者:玛丽亚keay (aut)
佩德罗,情歌(cre)
维护人员:佩德罗情歌< pmadrigal在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“ExpressionAtlas”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ExpressionAtlas”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ExpressionAtlas”)
| HTML | R脚本 | ExpressionAtlas |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R(> = 4.2.0)、方法Biobase,SummarizedExperiment,limma,S4Vectors,xml2,RCurl,jsonlite,BiocStyle |
| 进口 | 跑龙套,XML,httr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,testthat,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | spatialHeatmap |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ExpressionAtlas_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ExpressionAtlas_1.26.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | ExpressionAtlas_1.26.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | ExpressionAtlas_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExpressionAtlas |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExpressionAtlas |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ExpressionAtlas/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExpressionAtlas/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
