Bioconductor版本:Release (3.15)
实验对象(如summarizeexperiment或singlecel实验)是一个或多个类似矩阵的测试以及相关的行和列数据的数据容器。下游分析通常只需要原始数据的一个子集。例如,过滤出质量差的样品需要在分析之前排除一些列。experiment子集对象是一个容器,用于有效地管理相同数据的不同子集,而不必为每个新子集创建单独的对象。
作者:Irzam Sarfraz [aut, cre],穆罕默德·阿西夫[aut, ths]——约书亚·d·坎贝尔[au]
维护者:Irzam Sarfraz
引文(从R内,输入引用(“ExperimentSubset”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ExperimentSubset”)
超文本标记语言 | R脚本 | experiment子集类的介绍 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.0.0),SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,SpatialExperiment,TreeSummarizedExperiment |
进口 | 方法,矩阵,S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,covr统计数据,食物,嘘,scds,TENxPBMCData,气道 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ExperimentSubset_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | ExperimentSubset_1.6.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | ExperimentSubset_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ experiment子集 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentSubset/ |
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