ExperimentHub

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentHub

客户端访问ExperimentHub资源

Bioconductor版本:发布(3.12)

这个包为Bioconductor ExperimentHub web资源提供了一个客户机。ExperimentHub提供了一个中心位置，可以访问从实验、出版物或培训课程的数据。每个资源都有关联的元数据、标记和修改日期。客户端创建并管理检索文件的本地缓存，以实现快速和可重现的访问。

作者:Bioconductor Package Maintainer [cre]， Martin Morgan [aut]， Marc Carlson [ctb]， Dan Tenenbaum [ctb]， Sonali Arora [ctb]， Valerie Oberchain [ctb]， Kayla Morrell [ctb]， Lori Shepherd [aut]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer，请登录bioconductor.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本为“4.0”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ExperimentHub")

对于旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的这个包的版本文档，启动R并输入:

browseVignettes(“ExperimentHub”)

超文本标记语言	R脚本	创建ExperimentHub包
超文本标记语言	R脚本	实验班:访问实验班Web服务
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文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.15.10),AnnotationHub(> = 2.19.3),BiocFileCache(> = 1.5.1)
进口	跑龙套,S4Vectors,BiocManager,旋度,rappdirs
链接
建议	knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了	ExperimentHubData
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/ExperimentHub/issues
取决于我	adductomicsR,alpineData,benchmarkfdrData2019,biscuiteerData,bodymapRat,brainImageRdata,CellMapperData,clustifyrdatahub,curatedAdipoChIP,curatedMetagenomicData,DMRcatedata,FlowSorted.Blood.EPIC,FlowSorted.CordBloodCombined.450k,HDCytoData,HighlyReplicatedRNASeq,HumanAffyData,mcsurvdata,MetaGxBreast,MetaGxOvarian,MetaGxPancreas,muscData,NanoporeRNASeq,NestLink,restfulSEData,RNAmodR。数据,SCATEData,SeqSQC,sesameData,鞑靼,tcgaWGBSData.hg19
进口我	adductData,celldex,chipseqDBData,CLLmethylation,CopyNeutralIMA,curatedTCGAData,depmap,DMRcate,DropletTestFiles,DuoClustering2018,ENmix,ExperimentHubData,FieldEffectCrc,GSEABenchmarkeR,HarmonizedTCGAData,HCAData,HMP16SData,HMP2Data,MethylSeqData,MouseGastrulationData,PhyloProfile,PhyloProfileData,pwrEWAS.data,restfulSE,scRNAseq,signatureSearch,signatureSearchData,SingleCellMultiModal,singleCellTK,spatialLIBD,TabulaMurisData,TENxBrainData,TENxBUSData,TENxPBMCData
建议我	曾帮工,AnnotationHub,bambu,celaref,celarefData,CellMapper,curatedAdipoArray,DEqMS,GSE62944,HDF5Array,missMethyl,马斯喀特,recountmethylation,tissueTreg
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在你的R会话中使用这个包的说明。

源包	ExperimentHub_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	ExperimentHub_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ExperimentHub_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentHub
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExperimentHub
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentHub/
包下载报告	下载数据