epitxdb

doi:10.18129/b9.bioc.epitxdb

使用AnnotationDBI接口存储和访问关注分类图信息

生物导体版本:版本(3.15)

epitXDB促进了表面翻译信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修改身份,位置,将其引入RNA的酶,该酶是确定要修改的RNA上位置的指定符,并且文献参考每个修改都与之相关联。

作者:Felix G.M.恩斯特[aut,cre]

维护者:Felix G.M.ernst

引用(从r内,输入引用(“ epitxdb”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ EpitXDB”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ epitxdb”)

html R脚本 epitxdb
html R脚本 epitxdb-reation
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.0),AnnotationDbi,,,,modstrings
进口 方法,utils,httr,,,,XML2,,,,卷曲,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,生物基因,,,,Biocfilecache,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,rsqlite,,,,DBI,,,,生物弦,,,,Trnadbimport
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,httptest,,,,AnnotationHub,,,,Ensembldb,,,,GGPLOT2,,,,epitxdb.hs.hg38,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL https://github.com/felixernst/epitxdb
BugReports https://github.com/felixernst/epitxdb/issues
取决于我 epitxdb.hs.hg38,,,,epitxdb.mm.mm10,,,,epitxdb.sc.saccer3
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 epitxdb_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 epitxdb_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) epitxdb_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epitxdb
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/epitxdb
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/epitxdb/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网