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EpiDISH
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DOI:10.18129 / B9.bioc.EpiDISH
样本内异质性的表观遗传学解剖
Bioconductor版本:发行版(3.16)
EpiDISH是一个R包，用于推断样本中存在的先验已知细胞类型的比例，表示这些细胞类型的混合物。目前，该软件包可用于全血、一般上皮组织和乳腺组织的DNAm数据。此外，该软件包还提供了一种功能，可以在表观基因组关联研究中识别不同甲基化的细胞类型及其变化方向。
作者:Andrew E. Teschendorff [aut]，郑世杰[aut, cre]
维护人员:Shijie C. Zheng
引文(从R内，输入引用(“EpiDISH”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“EpiDISH”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 样本内异质性的表观遗传学解剖 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.14.1 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | 质量，e1071，quadprog，平行，统计，matrixStats，stringr，locfdr，矩阵 |
| 链接 | |
| 建议 | roxygen2，GEOquery，BiocStyle，knitr，rmarkdown，Biobase，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/sjczheng/EpiDISH |
| BugReports | https://github.com/sjczheng/EpiDISH/issues |
| 全靠我 | 烤面包 |
| 进口我 | |
| 建议我 | FlowSorted.Blood.EPIC，地球 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | EpiDISH_2.14.1.tar.gz |
| Windows二进制 | EpiDISH_2.14.1.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | EpiDISH_2.14.1.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | EpiDISH_2.14.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiDISH |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EpiDISH |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/EpiDISH/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EpiDISH/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.16的旧源包 | 源存档 |
