富集兄弟
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doi：10.18129/b9.bioc.enrichmentbrowser
通过基于集合和基于网络的富集分析的结合结果无缝导航
生物导体版本：版本（3.15）
富集兄弟软件包实现了基因表达数据富集分析的基本功能。该分析结合了基于集合和基于网络的富集分析的优势，以得出高信心基因集和生物学途径，这些基因集和生物学途径在所研究的表达数据中受到差异调节。此外，包装有助于对此类集合和途径的可视化和探索。
作者：路德维希·盖斯特林格[AUT，CRE]，Gergely Csaba [aut]，Mara Santarelli [CTB]，Mirko Signorelli [CTB]，Marcel Ramos [CTB]，Levi Waldron [CTB]，Ralf Zimmer [AUT]
维护者：hms.harvard.edu>的路德维格·盖斯林格
引用（从r内，输入引用（“富集”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ EnrichmentBrowser”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“富集”）
| R脚本 | 丰富的兄弟手册 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.26.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 总结性特征，，，，图形 |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，Biocfilecache，，，，生物管理器，，，，gseabase，，，，go.db，，，，keggrest，，，，kegggraph，，，，rgraphviz，，，，S4VECTORS，，，，Spia，，，，EDGER，，，，石墨，，，，HWRITER，，，，林玛， 方法，PathView，，，，安全的 |
| 链接 | |
| 建议 | 全部，，，，生物使用，，，，复杂的图像，，，，deseq2，，，，报告工具，，，，呼吸道，，，，生物图，，，，HGU95AV2.DB，，，，Geneplotter，，，，尼特，，，，msigdbr，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/lgeistlinger/enrichmentbrowser/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | GSEABENCHMARKER |
| 建议我 | GenomicSupersignature |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | EnrichmentBrowser_2.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | EnrichmentBrowser_2.26.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | EnrichmentBrowser_2.26.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichmentbrowser |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ronichmentbrowser |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enrichmentbrowser/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
