增强的Volcano

doi:10.18129/b9.bioc.enhancedvolcano

出版的火山土地具有增强的着色和标签

生物导体版本:版本(3.15)

火山图是可视化差异表达分析结果的有用方法。在这里,我们提出了一个高度可配置的功能,该功能可生产出出版的火山地块。EnhancedVolcano将尝试在绘图窗口中拟合尽可能多的点标签,从而避免使用无法读取的标签“堵塞”情节。其他功能允许用户通过颜色,形状,大小和阴影参数配置在同一情节空间中最多可识别多达4种不同类型的属性。

作者:Kevin Blighe [AUT,CRE],Sharmila Rana [AUT],Emir Turkes [CTB],Benjamin Ostendorf [CTB],Andrea Grioni [CTB],Myles Lewis [aut]

维护者:kevin blighe

引用(从r内,输入引用(“增强Volcano”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“增强Volcano”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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Browsevignettes(“增强Volcano”)

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细节

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版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(4年)
执照 GPL-3
要看 GGPLOT2,,,,Ggrepel
进口 方法
链接
建议 ggalt,,,,ggrastr,,,,运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,deseq2,,,,帕西拉,,,,呼吸道,,,,org.hs.eg.db,,,,栅格,,,,马格里特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/kevinblighe/enhancedvolcano
取决于我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 增强volcano_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 增强volcano_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) 增强volcano_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enhancedvolcano
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/增强volcano
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/enhancevolcano/
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