生物导体版本:版本(3.15)
火山图是可视化差异表达分析结果的有用方法。在这里,我们提出了一个高度可配置的功能,该功能可生产出出版的火山地块。EnhancedVolcano将尝试在绘图窗口中拟合尽可能多的点标签,从而避免使用无法读取的标签“堵塞”情节。其他功能允许用户通过颜色,形状,大小和阴影参数配置在同一情节空间中最多可识别多达4种不同类型的属性。
作者:Kevin Blighe [AUT,CRE],Sharmila Rana [AUT],Emir Turkes [CTB],Benjamin Ostendorf [CTB],Andrea Grioni [CTB],Myles Lewis [aut]
维护者:kevin blighe
引用(从r内,输入引用(“增强Volcano”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“增强Volcano”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“增强Volcano”)
html | R脚本 | 出版的火山土地具有增强的着色和标签 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(4年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | GGPLOT2,,,,Ggrepel |
进口 | 方法 |
链接 | |
建议 | ggalt,,,,ggrastr,,,,运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,deseq2,,,,帕西拉,,,,呼吸道,,,,org.hs.eg.db,,,,栅格,,,,马格里特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/kevinblighe/enhancedvolcano |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | 增强volcano_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | 增强volcano_1.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | 增强volcano_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enhancedvolcano |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/增强volcano |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enhancevolcano/ |
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