此包装适用于生物导体的3.15版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅ewce。
生物导体版本:版本(3.15)
用于确定哪些细胞类型在基因列表中富集。该软件包提供了在简单基因列表(例如与人类疾病相关的基因)中测试富集的工具以及由差异表达研究产生的工具。该软件包不取决于任何特定的单元转录组数据集,并且可以将用户定义的数据集加载到分析中。
作者:艾伦·墨菲(Alan Murphy)[CRE],Brian Schilder [AUT],内森·斯凯恩[aut]
维护者:Alan Murphy
引用(从r内,输入引用(“ ewce”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ ewce”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ewce”)
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版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(6年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.1),rnomni(> = 1.0) |
进口 | 统计,utils,方法,ewcedata,,,,dplyr,,,,GGPLOT2,,,,RESHAPE2,,,,林玛,,,,Stringr,,,,Hgnchelper,,,,矩阵, 平行,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,延迟,,,,生物比较,,,,正差(> = 0.99.8),Data.Table |
链接 | |
建议 | 远程,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 3.0.0),readxl,,,,备忘录,,,,降价,,,,sctransform,,,,deseq2,,,,桅杆,,,,延迟的matrixstats,,,,牛仔图,,,,ggdendro,grdevices,网格,栅格,,,,秤,,,,魔术,,,,獾 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/nathanskene/ewce |
BugReports | https://github.com/nathanskene/ewce/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ewce_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | ewce_1.4.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | ewce_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ewce |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ewce |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ewce/ |
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