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ERSSA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ERSSA
经验RNA-seq样本量分析
生物导体版本:发布(3.13)
ERSSA软件包采用用户提供的RNA-seq差异表达数据集，并计算不同生物复制水平上差异表达基因的数量。这允许用户在不依赖任何先验假设的情况下，确定其RNA-seq数据集是否已经实现了足够的差异检测。
作者:邵子轩[aut, cre]
保持者:子轩邵<子轩邵。扎克:gmail.com >
引文(从R中输入引用(“ERSSA”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install(“ersa”)
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ERSSA”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | ERSSA方案介绍 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.0.0) |
| 进口 | 刨边机(> = 3.23.3),DESeq2(> = 1.21.16),ggplot2(> = 3.0.0),RColorBrewer(> = 1.1 2),plyr(> = 1.8.4),BiocParallel(>= 1.15.8)， grDevices, stats, utils |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/zshao1/ERSSA |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | ERSSA_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ERSSA_1.10.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | ERSSA_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ERSSA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ERSSA |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ERSSA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
