eNCODEXPLORER.

DOI:10.18129 / b9.bioc.encodexplorer.

编码元数据的汇编

Bioconductor版本:释放(3.13)

此程序包允许用户快速访问编码项目文件元数据,并允许访问辅助函数以查询编码REST API,下载编码数据集并以SQLite格式保存数据库。

作者:Charles Joly Beauparlant 奥黛丽Lemacon ,Eric Fournier ,LouisGendron ,Astrid -Louise deschenes ,Arnaud droit >

维护者:Charles Joly Beauparlant

引文(从R内,输入引文(“encodexplorer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“encodexplorer”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

PDF. 参考手册

细节

Biocviews. bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 2.18.0
在生物导体中以来 BIOC 3.1(R-3.2)(6年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.6)
进口 方法,工具,雅思石rcurl.Tidyr.data.table.dplyr.stringr.stringi.,实用,annotationhub.Genomicranges.rtracklayer.S4Vectors.Genomeinfodb.Encodexplorerdata.
链接到
建议 运行生物根系kn卷曲Httr.闪亮的ShinyThemes.DT.
系统要求
加强
URL.
Bugreports. https://github.com/charlesjb/encodexplorer/issues.
取决于我
进口我
建议我 Tsrchitect
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制文件
Macos 10.13(高塞拉)
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/encodexplorer.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ encodexplorer
包短网址 https://biocodgetiond.org/packages/encodexplorer/
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文件»

生物体

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支持»

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