Bioconductor版本:释放(3.13)
此程序包允许用户快速访问编码项目文件元数据,并允许访问辅助函数以查询编码REST API,下载编码数据集并以SQLite格式保存数据库。
作者:Charles Joly Beauparlant
维护者:Charles Joly Beauparlant
引文(从R内,输入引文(“encodexplorer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“encodexplorer”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
PDF. | 参考手册 |
Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
版本 | 2.18.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.1(R-3.2)(6年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 3.6) |
进口 | 方法,工具,雅思石那rcurl.那Tidyr.那data.table.那dplyr.那stringr.那stringi.,实用,annotationhub.那Genomicranges.那rtracklayer.那S4Vectors.那Genomeinfodb.那Encodexplorerdata. |
链接到 | |
建议 | 运行那生物根系那kn那卷曲那Httr.那闪亮的那ShinyThemes.那DT. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
Bugreports. | https://github.com/charlesjb/encodexplorer/issues. |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Tsrchitect |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | |
Windows二进制文件 | |
Macos 10.13(高塞拉) | |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/encodexplorer. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ encodexplorer |
包短网址 | https://biocodgetiond.org/packages/encodexplorer/ |
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